Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL40Q2TBA0 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms