Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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