Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HIST3H3Q16695 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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