Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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