Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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