Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SGCAQ16586 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SGCAQ16586 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SGCAQ16586 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SGCAQ16586 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SGCAQ16586 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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SGCAQ16586 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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SGCAQ16586 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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SGCAQ16586 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
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