Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GRIK5Q16478 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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