Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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