Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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