Protein–RNA interactions for Protein: Q15648

MED1, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED1Q15648 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED1Q15648 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED1Q15648 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED1Q15648 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED1Q15648 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED1Q15648 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED1Q15648 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MED1Q15648 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED1Q15648 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MED1Q15648 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED1Q15648 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MED1Q15648 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED1Q15648 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED1Q15648 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED1Q15648 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED1Q15648 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED1Q15648 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED1Q15648 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED1Q15648 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED1Q15648 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MED1Q15648 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED1Q15648 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED1Q15648 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED1Q15648 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED1Q15648 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED1Q15648 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED1Q15648 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MED1Q15648 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED1Q15648 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED1Q15648 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED1Q15648 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED1Q15648 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED1Q15648 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MED1Q15648 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED1Q15648 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED1Q15648 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED1Q15648 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED1Q15648 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MED1Q15648 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED1Q15648 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED1Q15648 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED1Q15648 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED1Q15648 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED1Q15648 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MED1Q15648 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MED1Q15648 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MED1Q15648 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MED1Q15648 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MED1Q15648 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MED1Q15648 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MED1Q15648 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MED1Q15648 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MED1Q15648 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MED1Q15648 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MED1Q15648 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MED1Q15648 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MED1Q15648 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MED1Q15648 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MED1Q15648 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MED1Q15648 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED1Q15648 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED1Q15648 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED1Q15648 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED1Q15648 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED1Q15648 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED1Q15648 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED1Q15648 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED1Q15648 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MED1Q15648 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED1Q15648 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED1Q15648 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED1Q15648 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED1Q15648 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED1Q15648 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED1Q15648 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED1Q15648 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED1Q15648 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MED1Q15648 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MED1Q15648 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MED1Q15648 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED1Q15648 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MED1Q15648 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED1Q15648 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED1Q15648 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED1Q15648 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED1Q15648 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED1Q15648 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED1Q15648 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED1Q15648 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MED1Q15648 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MED1Q15648 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MED1Q15648 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MED1Q15648 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MED1Q15648 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MED1Q15648 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
MED1Q15648 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MED1Q15648 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
MED1Q15648 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
MED1Q15648 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MED1Q15648 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms