Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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TRIP10Q15642 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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TRIP10Q15642 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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TRIP10Q15642 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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TRIP10Q15642 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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TRIP10Q15642 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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TRIP10Q15642 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms