Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms