Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

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Length 657 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTPRRQ15256 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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PTPRRQ15256 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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PTPRRQ15256 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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PTPRRQ15256 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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PTPRRQ15256 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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PTPRRQ15256 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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PTPRRQ15256 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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PTPRRQ15256 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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PTPRRQ15256 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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PTPRRQ15256 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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PTPRRQ15256 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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