Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms