Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
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