Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NBR1Q14596 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms