Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM25Q14258 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM25Q14258 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms