Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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