Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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