Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PEX6Q13608 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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