Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRQ13535 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRQ13535 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRQ13535 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRQ13535 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRQ13535 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRQ13535 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRQ13535 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRQ13535 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRQ13535 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRQ13535 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRQ13535 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRQ13535 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRQ13535 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRQ13535 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRQ13535 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRQ13535 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRQ13535 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRQ13535 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRQ13535 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRQ13535 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRQ13535 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRQ13535 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRQ13535 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRQ13535 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRQ13535 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATRQ13535 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATRQ13535 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATRQ13535 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATRQ13535 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATRQ13535 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATRQ13535 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATRQ13535 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATRQ13535 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATRQ13535 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATRQ13535 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATRQ13535 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATRQ13535 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ATRQ13535 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATRQ13535 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ATRQ13535 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATRQ13535 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ATRQ13535 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATRQ13535 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATRQ13535 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATRQ13535 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATRQ13535 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATRQ13535 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATRQ13535 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATRQ13535 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATRQ13535 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATRQ13535 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATRQ13535 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATRQ13535 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATRQ13535 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATRQ13535 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ATRQ13535 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRQ13535 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRQ13535 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRQ13535 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRQ13535 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRQ13535 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRQ13535 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRQ13535 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRQ13535 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRQ13535 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRQ13535 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRQ13535 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRQ13535 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRQ13535 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRQ13535 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRQ13535 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRQ13535 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRQ13535 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRQ13535 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRQ13535 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRQ13535 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRQ13535 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRQ13535 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRQ13535 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRQ13535 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRQ13535 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRQ13535 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRQ13535 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRQ13535 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRQ13535 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRQ13535 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRQ13535 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRQ13535 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRQ13535 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRQ13535 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRQ13535 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRQ13535 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRQ13535 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRQ13535 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRQ13535 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRQ13535 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRQ13535 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRQ13535 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRQ13535 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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