Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

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Length 335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms