Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms