Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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CNTN1Q12860 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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CNTN1Q12860 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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CNTN1Q12860 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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CNTN1Q12860 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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CNTN1Q12860 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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