Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms