Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNA1Q09470 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms