Protein–RNA interactions for Protein: Q09428

ABCC8, ATP-binding cassette sub-family C member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC8Q09428 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ABCC8Q09428 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ABCC8Q09428 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ABCC8Q09428 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ABCC8Q09428 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ABCC8Q09428 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ABCC8Q09428 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
ABCC8Q09428 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ABCC8Q09428 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ABCC8Q09428 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ABCC8Q09428 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ABCC8Q09428 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ABCC8Q09428 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ABCC8Q09428 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ABCC8Q09428 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ABCC8Q09428 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
ABCC8Q09428 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ABCC8Q09428 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ABCC8Q09428 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ABCC8Q09428 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ABCC8Q09428 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ABCC8Q09428 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ABCC8Q09428 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ABCC8Q09428 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ABCC8Q09428 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ABCC8Q09428 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ABCC8Q09428 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ABCC8Q09428 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ABCC8Q09428 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ABCC8Q09428 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ABCC8Q09428 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ABCC8Q09428 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ABCC8Q09428 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ABCC8Q09428 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ABCC8Q09428 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ABCC8Q09428 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ABCC8Q09428 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ABCC8Q09428 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ABCC8Q09428 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ABCC8Q09428 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ABCC8Q09428 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ABCC8Q09428 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ABCC8Q09428 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms