Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SSRP1Q08945 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms