Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms