Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms