Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms