Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms