Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XPCQ01831 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
XPCQ01831 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
XPCQ01831 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XPCQ01831 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
XPCQ01831 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
XPCQ01831 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
XPCQ01831 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
XPCQ01831 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
XPCQ01831 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XPCQ01831 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XPCQ01831 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XPCQ01831 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XPCQ01831 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XPCQ01831 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
XPCQ01831 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XPCQ01831 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
XPCQ01831 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XPCQ01831 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XPCQ01831 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XPCQ01831 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XPCQ01831 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XPCQ01831 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XPCQ01831 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XPCQ01831 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
XPCQ01831 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
XPCQ01831 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XPCQ01831 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XPCQ01831 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XPCQ01831 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XPCQ01831 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XPCQ01831 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XPCQ01831 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XPCQ01831 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XPCQ01831 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XPCQ01831 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XPCQ01831 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
XPCQ01831 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XPCQ01831 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XPCQ01831 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XPCQ01831 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XPCQ01831 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XPCQ01831 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XPCQ01831 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XPCQ01831 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XPCQ01831 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XPCQ01831 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XPCQ01831 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XPCQ01831 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XPCQ01831 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XPCQ01831 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XPCQ01831 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XPCQ01831 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XPCQ01831 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XPCQ01831 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XPCQ01831 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XPCQ01831 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XPCQ01831 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XPCQ01831 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XPCQ01831 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XPCQ01831 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XPCQ01831 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XPCQ01831 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XPCQ01831 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XPCQ01831 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XPCQ01831 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XPCQ01831 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XPCQ01831 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XPCQ01831 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XPCQ01831 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XPCQ01831 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XPCQ01831 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
XPCQ01831 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XPCQ01831 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XPCQ01831 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XPCQ01831 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XPCQ01831 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
XPCQ01831 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XPCQ01831 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XPCQ01831 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
XPCQ01831 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XPCQ01831 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XPCQ01831 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
XPCQ01831 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
XPCQ01831 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
XPCQ01831 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
XPCQ01831 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XPCQ01831 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
XPCQ01831 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
XPCQ01831 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XPCQ01831 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XPCQ01831 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XPCQ01831 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XPCQ01831 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XPCQ01831 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XPCQ01831 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
XPCQ01831 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
XPCQ01831 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XPCQ01831 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
XPCQ01831 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms