Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms