Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK6Q00534 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms