Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms