Protein–RNA interactions for Protein: P78356

PIP4K2B, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 beta, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2BP78356 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIP4K2BP78356 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PIP4K2BP78356 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIP4K2BP78356 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIP4K2BP78356 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIP4K2BP78356 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIP4K2BP78356 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIP4K2BP78356 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIP4K2BP78356 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIP4K2BP78356 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIP4K2BP78356 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIP4K2BP78356 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIP4K2BP78356 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIP4K2BP78356 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIP4K2BP78356 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIP4K2BP78356 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIP4K2BP78356 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIP4K2BP78356 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIP4K2BP78356 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIP4K2BP78356 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIP4K2BP78356 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIP4K2BP78356 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIP4K2BP78356 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIP4K2BP78356 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PIP4K2BP78356 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIP4K2BP78356 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIP4K2BP78356 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PIP4K2BP78356 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIP4K2BP78356 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIP4K2BP78356 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIP4K2BP78356 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIP4K2BP78356 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIP4K2BP78356 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIP4K2BP78356 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIP4K2BP78356 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIP4K2BP78356 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIP4K2BP78356 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIP4K2BP78356 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIP4K2BP78356 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIP4K2BP78356 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIP4K2BP78356 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIP4K2BP78356 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIP4K2BP78356 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PIP4K2BP78356 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIP4K2BP78356 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PIP4K2BP78356 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PIP4K2BP78356 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIP4K2BP78356 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIP4K2BP78356 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIP4K2BP78356 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PIP4K2BP78356 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIP4K2BP78356 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIP4K2BP78356 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIP4K2BP78356 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIP4K2BP78356 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIP4K2BP78356 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PIP4K2BP78356 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PIP4K2BP78356 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms