Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2FP61218 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2FP61218 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2FP61218 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2FP61218 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2FP61218 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2FP61218 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2FP61218 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2FP61218 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2FP61218 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2FP61218 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2FP61218 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2FP61218 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2FP61218 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2FP61218 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2FP61218 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2FP61218 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2FP61218 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2FP61218 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2FP61218 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2FP61218 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2FP61218 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2FP61218 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2FP61218 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2FP61218 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2FP61218 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2FP61218 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2FP61218 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2FP61218 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2FP61218 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2FP61218 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2FP61218 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2FP61218 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2FP61218 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2FP61218 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2FP61218 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2FP61218 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2FP61218 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2FP61218 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2FP61218 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2FP61218 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2FP61218 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2FP61218 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2FP61218 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2FP61218 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2FP61218 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2FP61218 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2FP61218 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2FP61218 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2FP61218 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2FP61218 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2FP61218 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2FP61218 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2FP61218 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2FP61218 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2FP61218 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2FP61218 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2FP61218 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2FP61218 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2FP61218 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2FP61218 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2FP61218 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2FP61218 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2FP61218 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2FP61218 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2FP61218 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2FP61218 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2FP61218 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2FP61218 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2FP61218 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2FP61218 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2FP61218 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2FP61218 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2FP61218 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2FP61218 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2FP61218 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2FP61218 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2FP61218 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2FP61218 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2FP61218 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2FP61218 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2FP61218 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2FP61218 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms