Protein–RNA interactions for Protein: P55291

CDH15, Cadherin-15, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH15P55291 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH15P55291 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH15P55291 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH15P55291 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH15P55291 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH15P55291 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH15P55291 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH15P55291 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH15P55291 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH15P55291 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH15P55291 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH15P55291 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH15P55291 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH15P55291 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH15P55291 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH15P55291 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH15P55291 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH15P55291 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH15P55291 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH15P55291 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH15P55291 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH15P55291 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH15P55291 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH15P55291 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH15P55291 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH15P55291 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH15P55291 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH15P55291 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH15P55291 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH15P55291 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH15P55291 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH15P55291 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH15P55291 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH15P55291 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH15P55291 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH15P55291 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH15P55291 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH15P55291 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH15P55291 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH15P55291 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH15P55291 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH15P55291 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH15P55291 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH15P55291 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH15P55291 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH15P55291 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH15P55291 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH15P55291 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH15P55291 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH15P55291 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH15P55291 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH15P55291 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH15P55291 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH15P55291 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH15P55291 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH15P55291 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH15P55291 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH15P55291 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH15P55291 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH15P55291 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH15P55291 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH15P55291 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH15P55291 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH15P55291 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH15P55291 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH15P55291 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH15P55291 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH15P55291 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH15P55291 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH15P55291 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH15P55291 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH15P55291 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH15P55291 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH15P55291 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH15P55291 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH15P55291 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH15P55291 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH15P55291 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH15P55291 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH15P55291 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH15P55291 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH15P55291 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH15P55291 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH15P55291 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH15P55291 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH15P55291 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH15P55291 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH15P55291 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH15P55291 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH15P55291 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH15P55291 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH15P55291 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH15P55291 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH15P55291 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH15P55291 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH15P55291 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH15P55291 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH15P55291 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH15P55291 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH15P55291 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms