Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms