Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms