Protein–RNA interactions for Protein: P53597

SUCLG1, Succinate--CoA ligase [ADP/GDP-forming] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG1P53597 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SUCLG1P53597 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SUCLG1P53597 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SUCLG1P53597 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SUCLG1P53597 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SUCLG1P53597 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SUCLG1P53597 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SUCLG1P53597 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SUCLG1P53597 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SUCLG1P53597 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SUCLG1P53597 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SUCLG1P53597 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SUCLG1P53597 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SUCLG1P53597 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SUCLG1P53597 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SUCLG1P53597 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SUCLG1P53597 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SUCLG1P53597 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SUCLG1P53597 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SUCLG1P53597 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SUCLG1P53597 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SUCLG1P53597 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SUCLG1P53597 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SUCLG1P53597 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SUCLG1P53597 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SUCLG1P53597 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SUCLG1P53597 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SUCLG1P53597 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SUCLG1P53597 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SUCLG1P53597 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SUCLG1P53597 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SUCLG1P53597 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SUCLG1P53597 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SUCLG1P53597 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SUCLG1P53597 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SUCLG1P53597 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SUCLG1P53597 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SUCLG1P53597 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SUCLG1P53597 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SUCLG1P53597 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SUCLG1P53597 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SUCLG1P53597 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SUCLG1P53597 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SUCLG1P53597 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SUCLG1P53597 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SUCLG1P53597 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SUCLG1P53597 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SUCLG1P53597 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SUCLG1P53597 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SUCLG1P53597 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SUCLG1P53597 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SUCLG1P53597 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SUCLG1P53597 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SUCLG1P53597 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SUCLG1P53597 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SUCLG1P53597 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SUCLG1P53597 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SUCLG1P53597 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SUCLG1P53597 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SUCLG1P53597 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SUCLG1P53597 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SUCLG1P53597 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SUCLG1P53597 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SUCLG1P53597 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SUCLG1P53597 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SUCLG1P53597 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SUCLG1P53597 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SUCLG1P53597 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SUCLG1P53597 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms