Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2A2P52657 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms