Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCR4P51679 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCR4P51679 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCR4P51679 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCR4P51679 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCR4P51679 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCR4P51679 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCR4P51679 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCR4P51679 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCR4P51679 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCR4P51679 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCR4P51679 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCR4P51679 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCR4P51679 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCR4P51679 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCR4P51679 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCR4P51679 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCR4P51679 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCR4P51679 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCR4P51679 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCR4P51679 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCR4P51679 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCR4P51679 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCR4P51679 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCR4P51679 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCR4P51679 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCR4P51679 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCR4P51679 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCR4P51679 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCR4P51679 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCR4P51679 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCR4P51679 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCR4P51679 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCR4P51679 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCR4P51679 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCR4P51679 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCR4P51679 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCR4P51679 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCR4P51679 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCR4P51679 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCR4P51679 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCR4P51679 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCR4P51679 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCR4P51679 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCR4P51679 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCR4P51679 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCR4P51679 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCR4P51679 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCR4P51679 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCR4P51679 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCR4P51679 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCR4P51679 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCR4P51679 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCR4P51679 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCR4P51679 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCR4P51679 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCR4P51679 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCR4P51679 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCR4P51679 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCR4P51679 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCR4P51679 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCR4P51679 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCR4P51679 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCR4P51679 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCR4P51679 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCR4P51679 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCR4P51679 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCR4P51679 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCR4P51679 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCR4P51679 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCR4P51679 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCR4P51679 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCR4P51679 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCR4P51679 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCR4P51679 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCR4P51679 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCR4P51679 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCR4P51679 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCR4P51679 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCR4P51679 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCR4P51679 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCR4P51679 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCR4P51679 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCR4P51679 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCR4P51679 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCR4P51679 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCR4P51679 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCR4P51679 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCR4P51679 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCR4P51679 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCR4P51679 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCR4P51679 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCR4P51679 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCR4P51679 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCR4P51679 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCR4P51679 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCR4P51679 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCR4P51679 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCR4P51679 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCR4P51679 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms