Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms