Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCLMP48507 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCLMP48507 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCLMP48507 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCLMP48507 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCLMP48507 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCLMP48507 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCLMP48507 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCLMP48507 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCLMP48507 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCLMP48507 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCLMP48507 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCLMP48507 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCLMP48507 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCLMP48507 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCLMP48507 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCLMP48507 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCLMP48507 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCLMP48507 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCLMP48507 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCLMP48507 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCLMP48507 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCLMP48507 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCLMP48507 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCLMP48507 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCLMP48507 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCLMP48507 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCLMP48507 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GCLMP48507 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GCLMP48507 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GCLMP48507 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCLMP48507 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCLMP48507 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCLMP48507 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCLMP48507 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCLMP48507 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCLMP48507 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCLMP48507 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCLMP48507 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCLMP48507 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCLMP48507 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCLMP48507 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCLMP48507 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCLMP48507 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCLMP48507 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
GCLMP48507 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
GCLMP48507 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCLMP48507 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCLMP48507 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCLMP48507 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCLMP48507 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCLMP48507 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCLMP48507 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCLMP48507 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCLMP48507 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCLMP48507 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCLMP48507 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCLMP48507 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GCLMP48507 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCLMP48507 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GCLMP48507 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCLMP48507 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCLMP48507 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCLMP48507 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GCLMP48507 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCLMP48507 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCLMP48507 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GCLMP48507 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCLMP48507 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCLMP48507 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCLMP48507 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCLMP48507 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCLMP48507 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCLMP48507 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCLMP48507 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCLMP48507 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCLMP48507 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCLMP48507 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCLMP48507 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCLMP48507 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GCLMP48507 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCLMP48507 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCLMP48507 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCLMP48507 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCLMP48507 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCLMP48507 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCLMP48507 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCLMP48507 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCLMP48507 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCLMP48507 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCLMP48507 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCLMP48507 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCLMP48507 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCLMP48507 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCLMP48507 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCLMP48507 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCLMP48507 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCLMP48507 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCLMP48507 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GCLMP48507 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms