Protein–RNA interactions for Protein: P43003

SLC1A3, Excitatory amino acid transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A3P43003 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A3P43003 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms