Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMPOP42166 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TMPOP42166 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMPOP42166 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TMPOP42166 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TMPOP42166 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMPOP42166 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMPOP42166 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMPOP42166 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMPOP42166 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TMPOP42166 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMPOP42166 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TMPOP42166 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMPOP42166 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMPOP42166 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMPOP42166 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TMPOP42166 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMPOP42166 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMPOP42166 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMPOP42166 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TMPOP42166 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMPOP42166 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMPOP42166 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMPOP42166 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMPOP42166 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMPOP42166 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMPOP42166 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMPOP42166 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMPOP42166 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMPOP42166 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMPOP42166 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMPOP42166 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMPOP42166 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMPOP42166 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMPOP42166 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMPOP42166 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMPOP42166 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMPOP42166 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMPOP42166 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMPOP42166 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMPOP42166 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMPOP42166 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMPOP42166 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMPOP42166 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMPOP42166 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TMPOP42166 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMPOP42166 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMPOP42166 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMPOP42166 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMPOP42166 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMPOP42166 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMPOP42166 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMPOP42166 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMPOP42166 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMPOP42166 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMPOP42166 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMPOP42166 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMPOP42166 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMPOP42166 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMPOP42166 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMPOP42166 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMPOP42166 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TMPOP42166 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMPOP42166 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TMPOP42166 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMPOP42166 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMPOP42166 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMPOP42166 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMPOP42166 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMPOP42166 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMPOP42166 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMPOP42166 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMPOP42166 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMPOP42166 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMPOP42166 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMPOP42166 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMPOP42166 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMPOP42166 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMPOP42166 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMPOP42166 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMPOP42166 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMPOP42166 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMPOP42166 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMPOP42166 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMPOP42166 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMPOP42166 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMPOP42166 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMPOP42166 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMPOP42166 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMPOP42166 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMPOP42166 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMPOP42166 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TMPOP42166 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMPOP42166 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMPOP42166 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMPOP42166 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TMPOP42166 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMPOP42166 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMPOP42166 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMPOP42166 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms