Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms