Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms